En la estructura interna de la M.E. tiene la sustancia gris dispuesta centralmente en forma de H, con una asta anterior y otra posterior. Circundante a la substancia gris, se encuentra la substancia blanca, que tiene fibras longitudinales cortas y largas; éstas últimas ubicadas en la parte anterior (motoras) lateral (mixtas) y posteriores (sensitivas) de la médula espinal. En cortes transversales como el del esquema, la sustancia gris tiene el aspecto de cuernos: anterior ensanchado y el posterior afilado.
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